La letra r puede representar dos fonemas distintos, dependido de la posición en que aparezca: el fonema vibrante simple de aro, traje, en posición intervocálica; y el fonema vibrante múltiple de rosa y honra en posición inicial de palabra y después de una consonante que no pertenezca a la misma sílaba.
La r detrás de los prefijos ab-, sub- y post- pertenece a una sílaba distinta, y el sonido que representa es múltiple. Ejemplos: abrogar, subrogar, subrayar, postromántico.

Se escriben con r:

Al principio de palabra. Ejemplos: rana, risa, roto.
Detrás de las consonantes l, n y s. Ejemplos: enriquecer, alrededor, desrizar.
A comienzo del segundo elemento de la palabra compuesta con guion: Ejemplo: hispano-romano.
Las palabras que tienen el sonido vibrante en final de sílaba. Ejemplos: arpegio, perla olivar, amor.

Se escriben con el dígrafo rr:

Las palabras que tienen el sonido vibrante múltiple entre vocales. Ejemplos: cerro, barra, arrullo.

El segundo elemento de una palabra compuesta cuando el primero termina en vocal y el segundo empieza por r (fuerte), quedándose el sonido fuerte entre dos vocales. Ejemplos: (para + rayos) = pararrayos; (vi + rey) = virrey.

Palabras que se pueden escribir con r y con rr

La Real Academia admite en algunas palabras dos formas distintas de escritura (con r o con rr). Ejemplos: aturullar o aturrullar; bacará o bacarrá; cimborrio o cimborio; garapiñar o garrapiñar. (La forma que aparece en primer lugar es la preferida por la RAE).